Du kannst deine Eingangsrechnungen beim Erstellen schon einem Projekt zuordnen in dem du im Feld "Projekt" schon das gewünschte Projekt auswählst.
Nachträglich kannst du Eingangsrechnungen einem Projekt in der Übersicht aller Eingangsrechnungen zuordnen. Klicke dazu in der Übersicht der unzugeordneten Eingangsrechnungen auf den Aktion-Button und wähle "Beleg zuordnen".
Nun kannst du den Beleg nachträglich einem Projekt zuordnen. Anschließend erscheint er in der Übersicht der zurgeordneten Eingangsrechnungen.